Door de ligging direct achter de Wassenaarse duinen profiteert Nieuw-Wassenaar van een gematigd kustklimaat, waarbij de Noordzee zorgt voor koelere zomers en relatief milde winters. De nabijheid van de kustlijn maakt de wijk echter gevoelig voor krachtige zeewinden en snelle meteorologische schommelingen door binnenstroomde maritieme lucht.